Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FOXD4Q12950 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXD4Q12950 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms