Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TM6SF1Q9BZW5 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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