Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms