Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
MSMPQ1L6U9 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms