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| UPP1 | Q16831 | AL356596.1-201 | ENST00000624230 | 379 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | LINC01090-203 | ENST00000632331 | 466 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL391597.2-201 | ENST00000635698 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | ADGRG4-203 | ENST00000394143 | 9931 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | BBIP1P1-201 | ENST00000602999 | 279 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC004009.2-201 | ENST00000623016 | 728 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | DDX43P2-201 | ENST00000604753 | 1354 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | MARCH7-202 | ENST00000409175 | 2402 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | SNORD56.3-201 | ENST00000363507 | 71 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC019178.2-201 | ENST00000423595 | 505 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | NBDY-202 | ENST00000423617 | 543 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | MTCYBP41-201 | ENST00000528913 | 1123 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC135628.1-201 | ENST00000568867 | 534 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AP005380.1-201 | ENST00000584896 | 547 nt | TSL 4 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC080013.4-201 | ENST00000607624 | 649 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | MIR7106-201 | ENST00000612419 | 65 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC098617.1-218 | ENST00000628836 | 624 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| UPP1 | Q16831 | DLD-214 | ENST00000639772 | 421 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | NEB-204 | ENST00000409198 | 20637 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | HDX-201 | ENST00000297977 | 6200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| UPP1 | Q16831 | MFF-206 | ENST00000392059 | 1710 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |