Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NRF1Q16656 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms