Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms