Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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SNCBQ16143 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNCBQ16143 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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