Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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NPTX1Q15818 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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