Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
HERC1Q15751 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
HERC1Q15751 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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