Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
NKX1-1Q15270 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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NKX1-1Q15270 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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NKX1-1Q15270 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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NKX1-1Q15270 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NKX1-1Q15270 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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