Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms