Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RRP1BQ14684 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RRP1BQ14684 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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