Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CAPSQ13938 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms