Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NCOA4Q13772 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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