Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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