Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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ERCC8Q13216 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ERCC8Q13216 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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