Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
CALCOCO2Q13137 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms