Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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TRAF1Q13077 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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