Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms