Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms