Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
ERVV-2B6SEH9 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
ERVV-2B6SEH9 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ERVV-2B6SEH9 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ERVV-2B6SEH9 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
ERVV-2B6SEH9 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
ERVV-2B6SEH9 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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ERVV-2B6SEH9 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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ERVV-2B6SEH9 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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ERVV-2B6SEH9 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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ERVV-2B6SEH9 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ERVV-2B6SEH9 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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