Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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