Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
USP18Q9UMW8 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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