Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1Q9UJ41 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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