Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
EHD3Q9NZN3 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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