Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KCNS3Q9BQ31 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms