Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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UBXN4Q92575 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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UBXN4Q92575 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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UBXN4Q92575 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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UBXN4Q92575 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UBXN4Q92575 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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