Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PXDC1Q5TGL8 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PXDC1Q5TGL8 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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