Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL24A1Q17RW2 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL24A1Q17RW2 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms