Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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ZNF239Q16600 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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ZNF239Q16600 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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ZNF239Q16600 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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ZNF239Q16600 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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ZNF239Q16600 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
ZNF239Q16600 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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