Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CNGA3Q16281 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms