Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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