Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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