Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ALX1Q15699 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms