Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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