Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms