Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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COL19A1Q14993 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL19A1Q14993 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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