Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EXOSC2Q13868 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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