Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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IRF5Q13568 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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IRF5Q13568 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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IRF5Q13568 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
IRF5Q13568 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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IRF5Q13568 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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IRF5Q13568 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
IRF5Q13568 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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