Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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