Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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TCOF1Q13428 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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TCOF1Q13428 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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TCOF1Q13428 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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TCOF1Q13428 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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TCOF1Q13428 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
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TCOF1Q13428 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TCOF1Q13428 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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