Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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PTGDRQ13258 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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