Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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SEMA3BQ13214 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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SEMA3BQ13214 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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SEMA3BQ13214 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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SEMA3BQ13214 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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SEMA3BQ13214 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3BQ13214 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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