Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms