Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
DUSP4Q13115 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DUSP4Q13115 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms