Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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