Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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