Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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