Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
CTIFO43310 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
CTIFO43310 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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